锦鲤在幼鱼阶段很难分别雌雄。锦鲤长至成鱼后，雌雄就有区别了，我们就可以从头部、体型、腹部、胸鳍、生殖孔、等多方面区别它们。

1、头部

雌鱼头部稍窄并较长；雄鱼头部宽而短，额部稍突起。

2、体型

雌鱼身体较丰满，腹部膨大，越接近临产时腹部膨大越明显；雄鱼的体型较瘦长。

3、胸鳍

雌鱼的胸鳍端部呈圆形，较大；雄鱼的胸鳍端部略小而稍圆，粗壮而强硬。在生殖季节，雌、雄鱼的区别十分明显，雄鱼的胸鳍第一根鳍条和鳃盖上出现若干白色粒状小突起，称为“追星”，生殖季节过后“追星”自行消失。

4、腹部和生殖孔

雌鱼的腹部膨胀而柔软；雄鱼腹部小而坚硬，用手一摸即可判别。雄鱼生殖孔小而下凹；雌鱼生殖孔稍宽而扁平，微有外凸。